Il nucleo originario risale al Liceo Scientifico, fondato a San Pellegrino Terme nel 1969 come sezione staccata del Liceo “Filippo Lussana” di Bergamo (fino al 1973) e successivamente del Liceo “Edoardo Amaldi” di Alzano Lombardo.

Nel 1980, il Liceo venne trasferito a Zogno, presso il primo blocco dell’attuale edificio. Qui, venne affiancato da una sezione staccata dell’Istituto Tecnico Commerciale “Vittorio Emanuele” di Bergamo e da una dell’Istituto Professionale “Cesare Pesenti” di Bergamo, a cui si aggiunse l’indirizzo per Geometri nel 1987.

L’I.T.C. e il Liceo Scientifico ottennero l’autonomia rispettivamente nel 1985 e nel 1988. Nell’anno scolastico 1997-1998,  essi vennero unificati in un unico polo scolastico, al quale si aggiunse l’Istituto Professionale per l’Industria e l’Artigianato nel 1999-2000. Dall’anno scolastico 2006-2007, venne introdotto l’Istituto Magistrale con indirizzo socio-psico-pedagogico (ora Liceo delle Scienze Umane) e dal 2013-2014 il Liceo Linguistico.

Dall’anno scolastico 2014-2015, l’Istituto Professionale per l’Industria e l’Artigianato è stato sostituito dall’IeFP Operatore Elettrico in regime di sussidiarietà con la regione Lombardia.

Dall’anno scolastico 2019-2020, è stato introdotto il Liceo Scientifico ad indirizzo sportivo, rispondendo alle esigenze del territorio e alla vocazione sportiva dei nostri studenti che nel tempo hanno raggiunto traguardi significativi. Per l’anno scolastico 2022-2023, è stato attivato l’Istituto Tecnico ad indirizzo informatico.